A systematic interactome of SET1C expands its functional landscape and identifies candidate regulatory connections
本研究は酵母を用いた酵母二ハイブリッド法により SET1C 複合体の包括的な相互作用ネットワークを解明し、RNA 生合成や核内輸送における新たな役割、および Snf2 などのクロマチンリモデラーとのアールギニンメチル化を介した新たな制御機構を明らかにしました。
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molecular biology
365 件の論文
DNA topological regulation by topoisomerase IIβ-DNA-PK interaction is important for controlled hypoxia-inducible gene expression
本論文は、DNA-PK による TOP2B のリン酸化が、低酸素条件下での遺伝子発現制御において DNA 超らせん構造の形成を調節し、TOP2B と DNA-PK の相互作用を通じて低酸素誘導性遺伝子の転写を精密に制御する新たなメカニズムを明らかにしたものである。
Structure from Noise: Confirmation Bias in Particle Picking in Structural Biology
この論文は、クライオ電子顕微鏡法におけるテンプレートマッチングや深層学習などの粒子選択アルゴリズムが、純粋なノイズからも構造的な特徴を抽出してしまう「ノイズからの構造」現象（確認バイアス）を明らかにし、その対策を提案するものです。
Diverse bacterial pattern recognition receptors sense the core phage proteome
本研究は、細菌の STAND NTPase 超家族が、主要なカプシドタンパク質を含むファージのコアタンパク質群を多様な受容体ファミリーによって認識し、宿主因子 EF-Tu を組み込むことで広範な抗ウイルス防御を実現していることを明らかにしました。
More than just a passive brick in the wall: the nucleosome facilitates DNA polymerase β activity in linker DNA and its PARP-dependent regulation in the BER pathway choice
本研究は、ヌクレオソームが単なる障壁ではなく、隣接するリンカー DNA におけるポリメラーゼβの活性を促進し、PARP 依存的な調節を通じて短パッチと長パッチの塩基除去修復経路の選択を制御する動的なプラットフォームとして機能することを明らかにしました。
The lncRNA FENDRR fine-tunes FOXF1 protein levels through a negative feedback loop governing human embryonic lung fibroblast-to-myofibroblast transition
本論文は、長鎖非コード RNA の FENDRR が FOXF1 タンパク質レベルを負のフィードバック機構によって精密に制御し、ヒト胎児肺の線維芽細胞から筋線維芽細胞への移行を調節することで、肺発生や ACDMPV 疾患の病態に関与していることを明らかにしたものである。
Multi-objective Engineering of Trimethylamine Monooxygenase for Improved Thermostability and Cofactor Use
本研究は、トリメチルアミンモノオキシゲナーゼの多目的工学を通じて耐熱性と補因子（NADH）親和性の両立を試みた結果、完全な両立は困難であったものの、熱処理後の NADPH 活性維持や限定的な NADH 活性の保持に成功し、安定性と活性のトレードオフを克服するための新たな知見を提供したことを示しています。
Repurposed small molecule toxin inhibitors neutralise a diversity of venoms from the Neotropical viperid snake genus Bothrops
本論文は、既存薬の転用（marimastat、DMPS、varespladib など）が、中南米の Bothrops 属ヘビの多様な毒液に対する酵素活性や血液凝固・出血作用を中和し、ヘビ毒治療の新たな早期介入手段として有望であることを示しています。
A Real Time Quaking Induced Conversion (RT-QuIC) Assay for Detection of Misfolded Insulin Protein
本研究は、神経変性疾患のプリオンタンパク質検出用に開発されたリアルタイム・クエーキング誘起転換（RT-QuIC）アッセイをインスリンに適用し、臨床デバイスやマウスモデルから回収された凝集インスリンを検出・解析することで、代謝疾患におけるインスリン凝集の役割を解明する画期的な手法の概念実証を行ったものである。
Thiol methyltransferase METTL7B coordinates lipid metabolism and promotes tumor progression in pancreatic cancer
本論文は、膵癌において脂質代謝を調節し腫瘍の進行を促進するメチルトランスフェラーゼ METTL7B が、HNF4A/G によって転写制御され、脂質滴の蓄積を介して悪性形質を制御する新たな分子機構を解明したことを報告しています。
"Editing the conserved IPA1-TB1 regulatory module reshapes plant architecture and enhances tillering in wheat
CRISPR/Cas9 によるゲノム編集を用いて小麦の保存された IPA1-TB1 調節モジュールを改変したところ、分げつ数の増加と穂重の向上が実現し、高収量な小麦の作出に向けた有効な戦略が示されました。
Leveraging quadplexed digital PCR to characterize gene therapy vectors
本論文は、遺伝子治療ベクターの早期段階における品質評価を目的として、4 重多重 ddPCR とポアソン - 多項分布モデルを組み合わせる手法を提案し、その有効性、限界、およびベストプラクティスを示しています。
Protenix-v2: Broadening the Reach of Structure Prediction and Biomolecular Design
Protenix-v2 は、抗体 - 抗原複合体の構造予測精度の大幅な向上や、GPCR などの難易度の高い標的に対する高成功率のバイオ分子設計を実現し、創薬プロセスの加速に貢献する堅牢かつ強力なモデルであることを示しています。
Targeted sequencing of mutations via RNA-templated gap filling of oligonucleotides for single-cell RNA-seq
本論文は、Bst 全長 DNA ポリメラーゼの RNA 鋳型ギャップ充填およびリガーゼ活性を利用したプローブベースの手法を開発し、単一細胞 RNA シーケンシングにおいて全転写産物解析と多重的な変異プロファイリングを同時に実現する新たなアプローチを提案しています。
In-cell structural insights into fungal ER stress responses
本研究は、クライオ電子トモグラフィーなどの技術を用いて酵母の ER ストレスを解析し、翻訳抑制が ER ストレス応答に関与していることを構造的に実証した。
Learning latent conformational landscapes encoded in cryo-EM
本研究は、クライオ電子顕微鏡データが物理的に妥当な確率的コンフォメーションランドスケープを符号化しており、これを分子動力学シミュレーションと整合する生物学的に意味のある状態の連続体として解釈し、構造決定の質向上に直接活用できることを実証した。
Neuron-specific epigenetic repression of Cdk5 impairs hippocampal-dependent memory in male and female mice
本研究は、CRISPR/dCas9-HDAC3 を用いたエピジェネティック編集により興奮性ニューロンで Cdk5 のヒストンアセチル化を抑制すると、雄・雌の両マウスにおいて海馬依存性の記憶が障害されることを示し、Cdk5 のアセチル化が両性において記憶形成に不可欠であることを明らかにしました。
Transcriptional and spatial profiling of fibroblasts from human lungs highlights CTHRC1+ cells as fibrogenic signaling hubs in fibrosis
この研究は、単細胞 RNA シーケンシングと空間トランスクリプトミクスを統合して肺線維症の線維芽細胞の多様性を解明し、CTHRC1+ 細胞が線維化のシグナルハブとして機能することを示す一方で、標準的な培養法が本来の細胞特性を失わせる限界を明らかにしました。
RPL38 controls 60S ribosomal subunit homeostasis to regulate start-codon stringency and frame selection during C9ORF72 RAN translation
本論文は、リボソーム大サブユニットの構成タンパク質 RPL38 の発現低下が、C9ORF72 関連の RAN 翻訳における開始コドンの厳密性を低下させ、非標準的な開始やフレーム選択を促進することで、FTD/ALS の病態に関与する毒性タンパク質の産生を調節することを明らかにした。
Dual Recognition Drives Site-Directed G-Quadruplex Stabilization: Exploring Oligonucleotide Design in G4 Ligand-Oligonucleotide Conjugates
本論文は、G4 リガンドと相補的オリゴヌクレオチドを結合させた GL-Os において、ハイブリダイゼーションと G4 リガンド結合の協働作用が G4 構造の選択的安定化を駆動し、オリゴヌクレオチドの長さ、バックボーン、配列相補性を最適化することで、特定の G4 ターゲットへの結合と安定化を効率的に制御できることを示しています。